Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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