Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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TRAPPC6BQ86SZ2 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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TRAPPC6BQ86SZ2 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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TRAPPC6BQ86SZ2 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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TRAPPC6BQ86SZ2 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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