Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FAM187BQ17R55 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms