Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 LSM5-208ENST00000450169 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TTF1-201ENST00000334270 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SPTBN1Q01082 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms