Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC093283.1-201ENST00000565306 1075 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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PTPRMP28827 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 RPL7L1P11-201ENST00000446092 721 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PTPRMP28827 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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