Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD10P28358 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD10P28358 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD10P28358 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD10P28358 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD10P28358 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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