Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 OR2AT4-201ENST00000305159 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL049820.1-201ENST00000442936 423 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 C4orf22-205ENST00000508675 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AF186996.3-201ENST00000509527 964 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HLA-DMAP28067 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms