Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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PDK4Q16654 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PDK4Q16654 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDK4Q16654 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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