Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRRG1-201ENST00000378628 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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COL4A6Q14031 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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