Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
E2F1Q01094 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms