Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MED27-204ENST00000474263 762 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 THSD4-AS1-204ENST00000566268 468 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC005070.1-201ENST00000603744 365 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 IZUMO3-203ENST00000604921 743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC097717.1-251ENST00000608419 183 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 EEF1A1P15-201ENST00000395772 1408 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 EIF4A1P13-201ENST00000415667 230 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RASGRF2-AS1-201ENST00000505107 665 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TGFBR1P36897 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms