Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CCDC149-204ENST00000504487 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZNF185-212ENST00000539731 4334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 FAM182A-201ENST00000376398 5070 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 NLRP3-202ENST00000348069 3828 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
COL24A1Q17RW2 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms