Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF623-202ENST00000501748 6759 ntAPPRIS P3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CAPNS1P1-201ENST00000401029 633 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DEPDC5-202ENST00000382112 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 S1PR3-202ENST00000375846 8505 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF23-202ENST00000358700 2692 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SLC24A1-201ENST00000261892 5768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC1Q15751 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms