Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 PSG11-203ENST00000403486 1163 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ZNF337-AS1-206ENST00000455791 650 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 GGTA1P-204ENST00000488429 1104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AL034376.2-201ENST00000568110 573 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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BEST4Q8NFU0 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 CYP3A43-202ENST00000312017 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BEST4Q8NFU0 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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