Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PALM2-AKAP2B1ALY0 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms