Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 KCNE1B-202ENST00000618699 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 IL17A-201ENST00000340057 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 TPP1-215ENST00000533371 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRHP20396 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 ALKBH8-206ENST00000429370 2296 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC078881.1-201ENST00000507023 2161 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 DDR1-AS1-206ENST00000458361 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 SLFN11-201ENST00000308377 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 CNOT4-207ENST00000451834 3507 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 ECE1-202ENST00000357071 3763 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 CD28-202ENST00000374481 4526 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL031674.1-201ENST00000421642 486 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC100849.1-202ENST00000517949 562 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 FKBP5-204ENST00000542713 7384 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 HAO2-202ENST00000361035 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 SVILP1-201ENST00000422642 2676 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 MFAP5-201ENST00000359478 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 TMCC2-203ENST00000358024 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 OPTN-201ENST00000263036 2464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 DNTT-201ENST00000371174 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRHP20396 USP35-201ENST00000526425 3770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 GAPDHP72-202ENST00000636791 2141 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 OR1N1-201ENST00000304880 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 MIR636-201ENST00000384825 99 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 LINC01411-202ENST00000506862 744 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRHP20396 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms