Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PYM1-204ENST00000454792 884 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
KLHL42Q9P2K6 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
KLHL42Q9P2K6 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms