Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC137695.2-201ENST00000603123 754 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FANCFQ9NPI8 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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