Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 FPR3-202ENST00000595991 2222 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SIRT1Q96EB6 SMIM31-201ENST00000507311 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms