Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC026333.4-201ENST00000613543 544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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RTL8BQ17RB0 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FHL5-203ENST00000541107 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
RTL8BQ17RB0 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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