Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AP001527.1-201ENST00000566440 1957 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 FBN2-208ENST00000619499 10154 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 TRPM3-214ENST00000396292 4740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RASSF6-201ENST00000307439 5994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 LINC01226-208ENST00000640623 5019 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ARHGEF9-222ENST00000636048 5059 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL049651.1-201ENST00000440798 719 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms