Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL117192.1-204ENST00000553485 449 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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USP18Q9UMW8 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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USP18Q9UMW8 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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