Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 FABP9-201ENST00000379071 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RPL12P1-201ENST00000374520 498 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC079584.1-201ENST00000426716 464 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
IFFO1Q0D2I5 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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