Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC002115.2-201ENST00000640449 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD12P35452 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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