Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSSC4Q9Y5U2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSC4Q9Y5U2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms