Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRPRBQ9Y5M8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms