Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LRP12Q9Y561 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms