Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG6Q9Y2V7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG6Q9Y2V7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms