Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUDCQ9Y266 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUDCQ9Y266 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms