Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPSEQ9Y251 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPSEQ9Y251 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms