Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms