Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNND2Q9UQB3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNND2Q9UQB3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms