Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTF2Q9UNY4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms