Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED23Q9ULK4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED23Q9ULK4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms