Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MBD1Q9UIS9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MBD1Q9UIS9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms