Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms