Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFT172Q9UG01 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
IFT172Q9UG01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms