Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APEX2Q9UBZ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms