Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DBF4Q9UBU7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DBF4Q9UBU7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms