Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGAP28Q9P2N2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms