Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP35Q9P2H5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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