Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
MBD5Q9P267 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MBD5Q9P267 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms