Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMG20BQ9P0W2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms