Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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HOXC10Q9NYD6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXC10Q9NYD6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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