Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLCO1C1Q9NYB5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms