Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP4R2Q9NY27 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms