Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DEPPQ9NTK1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEPPQ9NTK1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms