Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HELLSQ9NRZ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HELLSQ9NRZ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms