Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms