Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SDHAF3Q9NRP4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDHAF3Q9NRP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms